海参幼体在水中不断地排出新陈代谢产物并消耗水中的溶解氧，同时死亡的幼体和饵料等也会逐渐腐败而放出有害物质。此外，由于不断地投饵，也势必带人一些营养盐等，这些因素都会使水质恶化影响浮游幼体的正常生活，严重时也会造成浮游幼体死亡。及时有效地换水是保持水质新鲜的重要方法。此外，在浮游幼体培养过程中，浮游幼体排泄的粪便、死亡的浮游幼体及饵料，海水中带来的悬浮物质不断沉到池底，天长日久腐烂后也会产生有害的物质如氨、硫化氢之类。此外，池壁上黏附的饵料等，时间一长也会腐败发黏，滋生大量的细菌等，必须经常清除，这就需要定期清除池底污物或在必要时迸行“倒池”。但由于刺参幼体浮游期较短，一般不超过10天，因此在海参浮游幼体培养过程申要视具体情况而定。
浮游幼体刚刚选育后开始妁2≈3天，由于水质尚比较新鲜，浮游幼体个体也小，饵料蓄积也不多，因此多数单位是采用添水的方法，每天添水10≈15厘米深，亦可分上、下午两次添加。也有的单位，育苗池较大，添水的时间可延至5天左右。近年，不少育苗单位采用浮游幼体选育时，就加满水，翌日即开始换水。换水时每天可换水1~2次，温度较高时可日换水2次，温度低时可日换水1次。每次换水量为池水的1/3~1/2。待幼体发育至大耳状幼体后期，即在浮游幼体即将下沉之前最好彻底清底一次，但如果池子较大，池底污物不多时亦可不清底，以免浮游幼体的流失。如需清底要采用虹吸法，紧贴池底将池底污物全部吸出。如吸出的海参幼体不多或大部分为畸形幼体，可将吸出的污水放掉，如所吸之水中含有一定数量的浮游幼体，则可用网箱将吸出的水浓缩后暂时放入其他容器中，等到污物全部沉淀后再将上面的清水连同浮游幼体倒回原地。如无特殊需要，清底1次或不清底均可，最好不“倒池”，因为“倒池”往往会造成浮游幼体的大量损伤。如有特殊情况必须“倒池”时，可用网箱将浮游幼体浓缩后再倒入新池。
各地因具体情况其换水方法虽不尽相同，但其共同点是设法排掉原培育池中的海水，排水时应防止浮游幼体的流失。
在较大海参水体育苗时可采用过滤棒，即在一个多孔的粗聚氯乙烯管(直径可为30~40厘米)的外面包上适宜的筛绢(塑料管孔可用钻头打孔)，其塑料管一端焊死，另一端焊出一个较细的塑料管，然后将适宜的橡皮管接在细塑料管上，把过滤棒放到育苗池底，将橡皮管的另一端留在池外，再用虹吸法把海水排出，因海参浮游幼体不能透过筛绢而被阻留在池内。排水完毕应轻轻抖动过滤棒，把滞留在筛绢上的浮游幼体冲回培育池。值得注意的是，因刺参幼体较柔弱，因此排出速度不宜太快，即吸力不能太强：另外要避开浮游幼体集中区，以免因浮游幼体大量贴网而致其损伤。
当浮游幼体下沉后，上中层浮游幼体已减少，可用网箱换水。
具体做法是用筛绢做成长筒形的网箱套，套在事先按所需尺寸已做好的框架上。把网箱放人培育池中，应注意网箱只能进水，不能进浮游幼体，然后从网箱的上口把胶管插人网箱水中，用虹吸法向外抽水。
另外，加水时可从加水管直接将沙滤水加人，但在较大的培养池(如5米×5米以上)也可在不同部位设2~3个注水管口，这样可使各部分注水较均匀。也有的单位在池底设几个鸭嘴式的进水口，这样加水时水从下面加入，可充分搅动水体，并在池上面留有溢流管或溢流口，再溢流管口应罩上筛绢以防止浮游幼体外流。
底部进水与上部溢水同时进行，这种换水方法最好在浮游幼体已转人底栖后使用，否则溢水口因水的压力较大，会使集中在上层的浮游幼体大量贴网损伤，因此在浮游幼体未转入底部或附着之前最好不采用此法。
一般，刺参的浮游阶段的换水多采用NX79的筛绢(约为200目)为适宜。稚海参及幼海参期的换水可根据需要换用网眼较大的纱网(20~60目)，以利于排出水中污物。选择筛绢的主要原则是网眼必须小于浮游幼体。筛绢网眼大多是正方形(GG型除外)，所用筛绢网孔正方形的对角线必须小于浮游幼体的体宽(因浮游幼体的长大于宽)，对角线的长度为边长的1.4倍左右。
现在，多数育苗室的换水方法已采用小网箱浓缩法，采用此法多个水池可同时进行换水，省时省力，便于大规模育苗生产：缺点是易损伤浮游幼体，因此在操作时，通过网箱的水流不能太急，网箱中被浓缩的浮游幼体应及时掏出或更换网箱，为减少浮游幼体贴网，应不断拍打网箱外部，以尽量减少对浮游幼体的损伤。
