在整个饲养土鳖的过程中，种卵的孵化管理是最关键的环节。它直接关系到饲养成功与否，以及经济效益的好坏。
原则：保温、保湿、透气
孵化方法可有多种，如：室内控温孵化，恒温孵化箱，煤油灯加温孵化。
我认为，后两种方法都只适于小型的饲养户，并且在温度控制操作上都不如室内控温孵化来得直接。
孵化不在室外进行。应在通风较小，温度平衡的室内，温差过大时，正在出虫的卵也会停止出虫，5-7天才能恢复正常。在冬天孵化时，应特别注意这一问题。
卵块放置内壁光滑的塑料盆内，50公分直径的塑料盆内可放置4-5公斤种卵，拌入种卵体积三分之二的饲养土。饲养土的湿度保持在35%-40%左右(手抓成团，一打即碎)，连卵带土厚8-10厘米。饲养土应预先配制好，放置孵化室内预热温差不超过5℃。
种卵在一定温湿度状态下不断生长发育。在生长发育过程中 ，锯齿形的透气孔也不断吸入饲养土中的水分。经过3-5天，饲养土便逐渐干燥。这时不能向其上喷水加湿，而应把干燥的饲养土筛出，拌入新的预热过的饲养土(经喷水的饲养土易板结，把卵块的透气孔堵住，导致幼虫在卵块中闷死)。在换土的同时，也会有部分幼虫，可直接放入坑池中饲养。
在孵化期间，温度应始终保持在25℃-30℃(饲养土内温度)，以28℃为最佳。每天用手翻动种卵1-2次，增加饲养土中空气新鲜度。翻动时动作要轻,以免碰伤卵块。
经30天左右孵化，开始有部分幼虫陆续破壳而出。这时饲养土表面有部分螨虫发生(螨虫原寄生于破损的卵块中)，这是要大批出虫的征兆，不必惊慌。有螨虫时用窗纱做成的筛子把螨虫筛掉。40-43天时大量的幼虫破壳而出，这时我们会看到数以万计的幼虫。这时2天便筛一次，把幼虫按比例分养。
筛小虫时手脚要轻，以免碰伤幼虫。(幼虫为乳白色，形似芝麻，我们俗称“芝麻虫”)。在大批出虫后，部分出掉虫的空壳夹杂其中，在筛小虫的过程中空壳响声较大时，可用簸箕把空壳簸掉。簸空壳时注意温差。
在孵化后期时也会出现部分螨虫，这都是正常情况，把螨虫筛掉便行了。经50-60天孵化，大部分幼虫都会出来，此时的卵块部分僵死，这也是正常情况，任何孵化都不可能100%。
