1、常温贮藏
在生产地区和产地附近销售成熟的木瓜，包装房或转运外的贮藏只是临时，库房只求达到通风良好，清洁卫生条件即可。因为贮藏期短而不要求有冷温条件，这样，在夏热冬冷的室温下，经营者必须根据木瓜热天后熟快，容易腐烂，而冬天后熟慢的特点，合理组织销售。
秋冬季采收的成熟果实，有时还需要用人工催熟方法加速果实后熟，以便应市。
催熟方法是在每一包装箱内，放入纸包滴上水的电石小量，包封包装不让透风，经1-2日夜，果皮转为鲜黄，即可食品用。冬季采收的木瓜，当地较为冷凉的大气温度，有利于果实的贮藏，若要求北运到大气温度低于12℃以下的地区，则要求运输车箱具有防冷设施，以避免果实产生冷害。
2、低温贮藏
低温贮藏木瓜果实，可以延长贮藏寿命，因此，这种贮藏方法特别适合于远途地面运输和远距离市场销售的需要。低温贮藏是把经热水浸果、熏蒸或辐射处理后的木瓜，立即转移到大约13℃温度的贮藏库或运输车箱内，在这个温度下，木瓜一般能够贮藏2-3周时间，在以后移置室温下后熟时能够正常后熟，保持果实品质。
低温处理的木瓜，要求至少在开始变黄的成熟阶段采收比较合适，因为这个阶段的木瓜对冷害比较不敏感。与低温贮藏相结合的几个实验说明，低压贮藏可以减少木瓜果实腐烂的发展，但仅是在抑制病菌的生长方面起到作用；其他一些气调贮藏是在低温下和1%-1.5%含氧量的控制气体条件下，获得延长为数不多的贮藏时间。
这些实验都需要与传统的采后处理、热处理、杀菌剂处理和冷藏条件相配合，而附加的低压或气调实验提高了成本经费，故在商业实践上尚末使用。
