氯溴异氰尿酸的作用与功效主要是杀菌、抗病毒。比如水稻有细菌性条斑病、稻瘟病、根腐病、茎腐病等，或者叶类蔬菜有病毒病、青枯病、霜霉病、枯萎病等，瓜类有霜霉病、白粉病、病毒病、叶斑病等。
氯溴异氰尿酸对作物有内吸和保护的双重功能，喷施在作物表面能慢慢地释放氯和溴，形成次氯酸和次溴酸，氯溴异氰尿酸主治的病害较多，分别防治水稻、农作物、瓜果蔬菜、花卉草坪中的病害：
1、水稻：白叶枯病、细菌性条斑病、纹枯病、稻瘟病、根腐病、恶苗病、茎腐病等。
2、叶类蔬菜：白菜软腐病、病毒病、青枯病、炭疽病、霜霉病、枯萎病、疫病等。
3、瓜类：霜霉病、菌核病、白粉病、角斑病、病毒病、枯萎病、叶斑病等。
4、茄科蔬菜：晚疫病、青枯病、腐烂病、病毒病等。
5、苹果、梨、桃：黑星病、褐斑病、腐烂病、轮纹病、穿孔病、流胶病等。
6、花卉草坪：病毒病、根腐病、基腐病等。
7、小麦、玉米：纹枯病、赤霉病、锈病、粗缩病、叶斑病、立枯病。
8、生姜：姜瘟病、青枯病等。
尽管氯溴异氰尿酸可混配药剂有很多，但也有使用禁忌，不能和有机磷农药、碱性农药混用。与有机磷农药混用会产生药害，或者引起火灾，与碱性农药混用会失去药效。不能与磷酸二氢钾混用，容易产生药害。
氯溴异氰尿酸与其他农药（除有机磷、碱性农药外）混用，要先在容器中加水，再加氯溴异氰尿酸进行稀释，然后把已经稀释过的要混配的药剂加入到稀释过的氯溴异氰尿酸药液中进行混用。混配顺序不当可能会直接在喷雾器内发生着火，甚至在喷雾器内出现爆炸现象。
