实施测土配方施肥后改变了部分地区农民重施、偏施氮肥的习惯，减少了不合理化肥施用量，优化了肥料施用结构，提高了肥料利用率。作为一项科学施肥技术，测土配方施肥实施效果非常明显，对促进粮食稳定增产、农业节本增效、农民持续增收和节能减排发挥了积极作用。
1、推广测土配方施肥技术后，可以改变农民重施或偏施氮肥的习惯，减少不合理的化肥的施用量，优化施肥结构，提高肥料的利用率。为防止氮肥、磷肥产能盲目扩张及钾肥资源配置发挥了积极作用，促进了肥料产业、施肥结构优化调整，配方肥施用比例逐步上升，氮肥用量过快增长的势头得到初步控制。
2、在南方水果生产区推广测土配方施肥技术后，不合理的肥料施用量平均可减少5.11公斤/亩。按此推算，截至2011年，全国累计减少不合理施肥700多万吨，相当于节约燃煤1820万吨、减少二氧化碳排放量4730万吨。同时，减少氮、磷流失6%-30%，有效减轻了面源污染。
3、推广测土配方施肥技术，农民科学施肥意识明显增强，农民重化肥、轻有机肥、偏施氮肥等传统观念正在发生变化。据对农户抽样调查，在小麦、水稻和玉米生产中，分别有77.4％、69.0％和66.4％的农户采用了测土配方施肥技术。综合各地试验示范数据测算，测土配方施肥与农户习惯施肥相比，肥料利用率明显提高，小麦氮、磷、钾肥利用率分别提高7.7、5.3和4.6个百分点，玉米分别提高9.4、7.6和8.1个百分点。
4、推广测土配方施肥技术后，可减少化肥的残留量，让土壤中的化肥尽可能被作物吸收，同时还能改善土壤的理化性状，增强保水保肥能力，平衡土壤中投入与支出的养分，继而达到提高产量、减少污染、提高农业综合生产能力的效果。
初步摸清了土壤养分校正系数、土壤供肥量、肥料利用率等基本参数，基本掌握了水稻、小麦、玉米、马铃薯等主要作物需肥规律，采用测土配方施肥技术的田块，小麦、水稻、玉米亩均增产3.7%、3.8%、5.9%，增收30元以上；蔬菜、果树等园艺作物亩均增收达100元以上。
